［學群＋區域］雙軸線經營
旗美社大立校之初的課程經營，原先只有【學群】架構；同時，由於學區幅員遼闊，旗美社大在創校的第一年，也確立了拓展社區分班的路線。社大的每一個班級，都設有探課員，探課員主要的任務是跟隨班級的學習腳步，一方面解決班上的相關問題，另方面則協助課程的發展。
社大課程的挑戰，可以分成規劃和經營面。在多年的經營之後，我們觀察到，各門課程間的連結，除了四大學群架構之外，還有另外一個不可忽視的「區域」因素。在規劃一門課程的時候，必須清楚地掌握課程所在社區的各種實際狀況，例如適當的學習形式和內容是什麼？將面對何種學員？同一個區域的各門課程之間，以及課程與社區之間，應當如何互動？隨著在地經營時日的拉長，以及社區分班的拓展，區域作為一項課程規劃與經營的因素，益見其重要性。
社區分班經營的挑戰，表現在兩個方面，第一是【量】的挑戰，辦公室的人力編制固定，但隨著班級數的增加，尤其是各社區分班越拓越多、越拓越遠的時候，探課分工出現了辦公室專職人力無法負荷的情況，於是在2004年，開始設置兼職的社區探課員。第二是【質】的挑戰，學習是一個動態的發展過過程，分班經營更考驗了社大工作者對於社區的認識與理解，以及社區關係，在2009年，旗美社大在學群之外，增加了「區域分工」方式，將課程與相關工作，以各鄉鎮區為單位，分由不同夥伴負責。
以流域作為區域分工方式
但此種以各鄉鎮區為單位的分工方式，在後來的運作上，卻遭遇了兩個困難。第一個困難是，各區域由單人負責，在平日的經營上，缺乏討論，也相互支持的對象，面臨了孤軍作戰的情境；第二個困難是，一旦人事異動，即使通過各種制度上的努力，既有的工作關係和成果，仍然難以完全交接。旗美九鄉鎮面積和人口有大有小，規模不一，也各有其自然和社會脈絡，在經營上需要長時間的累積。為了改善上述經營困境，社大團隊在2014年提出了新的區域分工架構，劃分成【楠梓仙溪】、【荖濃溪】，以及【濁口溪和羅漢內外門】三個區域。河川孕育了各種文明，每一條流域都存在著各種族群依山傍水而生，以流域分工的方式除了可以避免前述的問題，也更具有一種生命的視野。
